MovableTypeの初期設定のように、固定リンク（Permalink）の表示方法はサイドバーのない表示の方が一般的のように思います。 そうなると印刷用っていうのと同じになります。固定リンクとして一つにしたほうがシンプルで良いと思います。
pebble.controller.action.ViewBlogEntryAction
の最後の部分で、printable=trueのパラメータを判別していますが、
elseのブロックもprintableのテンプレートでリターンするようにします。
printableのリンクを使わないようにすればこのテンプレート
(/themes/*/jsp/printableTempalte.jsp)を自由に変更できます。
別のテンプレートを用意することでも対応できます。